哺乳動(dòng)物細(xì)胞系：對于常見的貼壁或懸浮哺乳動(dòng)物細(xì)胞系（如 HeLa、HEK293T），常規(guī)的 Western 裂解液（含 SDS、Tris - HCl、NaCl 等）可高效裂解細(xì)胞。SDS 能迅速破壞細(xì)胞膜，使蛋白質(zhì)變性，釋放細(xì)胞內(nèi)總蛋白，適用于 Western Blot 檢測蛋白表達(dá)水平；溫和型 IP 裂解液（含 Triton X - 100 等）則可保留蛋白質(zhì)天然構(gòu)象，滿足免疫沉淀研究蛋白質(zhì)相互作用的需求。例如在研究腫瘤細(xì)胞信號通路蛋白時(shí)，Western 裂解液提取的蛋白可清晰顯示蛋白表達(dá)量變化，IP 裂解液則能有效富集相互作用蛋白復(fù)合物 。

原代細(xì)胞：原代細(xì)胞結(jié)構(gòu)和功能更接近體內(nèi)狀態(tài)，但相對脆弱。使用裂解液時(shí)需避免過度處理，宜采用溫和裂解條件和低濃度表面活性劑的裂解液，以減少對細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能的破壞。如在神經(jīng)原代細(xì)胞研究中，強(qiáng)裂解液可能導(dǎo)致離子通道蛋白等敏感蛋白失活，而溫和裂解液配合輕柔的振蕩或短時(shí)超聲，既能有效裂解細(xì)胞，又能維持蛋白質(zhì)活性，保證后續(xù)實(shí)驗(yàn)中蛋白功能分析的準(zhǔn)確性 。

細(xì)菌和酵母細(xì)胞：這類細(xì)胞具有細(xì)胞壁，普通裂解液難以滲透。處理細(xì)菌樣本時(shí)，常需添加溶菌酶先破壞細(xì)胞壁，再配合含有較強(qiáng)去垢劑（如 Sarkosyl）的裂解液裂解細(xì)胞膜；酵母細(xì)胞則可通過研磨珠破碎結(jié)合裂解液處理。相較于哺乳動(dòng)物細(xì)胞，細(xì)菌和酵母細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)種類和豐度差異大，裂解后需注意去除核酸等雜質(zhì)，避免干擾后續(xù)蛋白質(zhì)分析。例如在研究酵母細(xì)胞周期蛋白時(shí)，需優(yōu)化裂解液成分和處理方法，確保目標(biāo)蛋白充分釋放且雜質(zhì)干擾最小化 。

軟組織（如肝臟、脾臟）：軟組織細(xì)胞間連接相對疏松，但細(xì)胞類型多樣，蛋白質(zhì)組成復(fù)雜。使用添加蛋白酶 K 等消化酶的裂解液，可幫助分解細(xì)胞間質(zhì)，促進(jìn)細(xì)胞裂解和蛋白質(zhì)釋放。在肝臟組織蛋白質(zhì)組學(xué)研究中，此類裂解液能有效裂解肝細(xì)胞、庫普弗細(xì)胞等多種細(xì)胞，獲得全面的蛋白質(zhì)提取物，但需注意控制消化酶用量和作用時(shí)間，防止蛋白質(zhì)過度降解 。

纖維成分較多的組織（如肌肉、皮膚）：由于含有大量膠原蛋白等纖維成分，單純裂解液處理難以充分裂解細(xì)胞。需結(jié)合機(jī)械勻漿（如組織勻漿器）或超聲破碎等物理方法，先破碎組織，再利用裂解液釋放蛋白質(zhì)。在肌肉組織研究中，物理破碎使肌纖維結(jié)構(gòu)破壞后，裂解液才能有效滲透到細(xì)胞內(nèi)。同時(shí)，此類組織中纖維蛋白含量高，提取蛋白質(zhì)時(shí)需通過離心等方式去除沉淀，避免影響后續(xù)分析 。

植物組織：植物細(xì)胞具有堅(jiān)硬的細(xì)胞壁（主要成分是纖維素、果膠等），需使用含有纖維素酶、果膠酶等成分的裂解液，先破除細(xì)胞壁，再裂解細(xì)胞。此外，植物細(xì)胞內(nèi)含有大量次生代謝產(chǎn)物（如酚類、多糖），這些物質(zhì)會與蛋白質(zhì)結(jié)合，影響蛋白質(zhì)提取和后續(xù)實(shí)驗(yàn)。因此，植物組織裂解液中常添加 PVP（聚乙烯吡咯烷酮）等吸附劑去除酚類物質(zhì)，通過高鹽 - 低 pH 等緩沖體系分離多糖，以獲得高質(zhì)量的植物蛋白質(zhì)提取物 。